царского посланника графа Толстого. Последний предъявил Алексею письмо Петра, где царевичу гарантировалось прощение любой вины в случае немедленного возвращения в Россию. Письмо это, однако, не смогло заставить Алексея вернуться. Тогда Толстой подкупил австрийского чиновника, чтобы тот «по секрету» сообщил царевичу, что его выдача в Россию — вопрос решённый. Это убедило Алексея, что расчёты на помощь Австрии ненадёжны. Решив, что помощи от Карла VI он не получит, и страшась насильственного возвращения в Россию, Алексей через французского офицера Дюре тайно обратился с письмом к шведскому правительству с просьбой о помощи. Однако данный шведами ответ (шведы обязались предоставить Алексею армию для возведения его на престол) запоздал, и царевич дал согласие на возвращение в Россию.
После возвращения за тайное бегство и деятельность во время пребывания за границей Алексей был лишён права на престолонаследие, причём он сам дал торжественную клятву об отказе от престола в пользу брата Петра Петровича в Успенском соборе Кремля в присутствии отца, высшего духовенства и высших сановников.
При этом ему было объявлено прощение на условии признания всех совершённых и известных к тому моменту проступков. При этом объявлялось, что за все, что царевич утаил, ему придется нести ответственность. Уже на следующий день после церемонии отречения началось следствие, порученное Тайной канцелярии и возглавленное тем же графом Толстым. Алексей в своих показаниях постарался изобразить себя жертвой своего окружения и перевести на своих приближённых всю вину. Лица, его окружавшие, были казнены, но это не помогло Алексею — его любовница крепостная Ефросинья, вместе с которой он прятался в Европе, дала исчерпывающие показания, изобличившие Алексея во лжи. Своей откровенностью Ефросинья спасла себе жизнь. После окончания следствия она была признана невиновной, получила от царя деньги на приданое и вышла замуж за офицера.
Также в одной из исповедей в церкви Алексей рассказал о том, как негативно он относится к своему отцу и всему тому, что он делает. Хоть тогда и существовала тайна исповеди, священник все равно донёс на Алексея, считая, что царская власть превыше.
Руководствуясь фактами, полученными во время следствия, 24 июня 1718 года Алексей был осуждён на смерть как изменник.
Умер он уже 26 июня, согласно официальной версии, «от удара». В 19 веке были обнаружены документы, согласно которым, царевича незадолго до смерти, уже после вынесения приговора, пытали, и эта пытка могла стать непосредственной причиной его смерти. Есть также версия, что Петру посоветовали отравить царевича, чтобы не мучился.
Пётр I опубликовал официальное извещение, где говорилось, что, выслушав смертный приговор, царевич пришёл в ужас, потребовал к себе отца, просил у него прощения и скончался по-христиански, в полном раскаянии от содеянного.
Еще говорят, что Алексея, отказавшегося принимать яд, на самом деле насильно повалили на пол темницы и в порыве гнева отрубили ему голову. Затем, чтобы скрыть эту страшную картину, пригласили некую Анну Крамер, одну из близких женщин Петра, которая пришила Алексею голову. Затем его приодели, чтобы скрыть следы избиений, а шрам на шее прикрыли большим галстуком. Картина, если честно, жуткая. Крамер, кстати, после смерти Алексея была удостоена чести, став фрейлиной Екатерины, а после смерти Петра сразу же уехала к себе в деревню, где и провела остаток своих дней в непрестанных молитвах и покаянии.
Похоронили Алексея в Петропавловской крепости в присутствии отца. Посмертная реабилитация Алексея и изъятие из обращения осуждающих его манифестов произошли во время недолгого царствия его сына Петра II.
